鹽田生態文化村的前身為「南寮鹽村」，位於臺南鹽場最早的鹽田中間，由於 當時 的 行政區是位於台南州新豐郡安順庄，因此命名為「安順鹽場」，為 「臺灣製鹽會社」 開闢較早的鹽場。「臺灣製鹽會社」成立於日治大正八年 (西元1919年)7月16日，會社位置位於安平怡記洋行西側。鹽場同年開始開闢， 完全竣工於日治大正十二年 (西元1923年)。 　 鹽村起初較為簡陋，同時也缺乏飲水，直到民國四十一年才開始有自來水，並 於鹽村開設衛生所和鹽工之家，到了民國四十二年，新式住宅完工，鹽村才發 展完備。 　 民國八十年八月經濟部於台南市安南區設置「台南科技工業區」，由於環保團 體預見工業區的開發，將對自然生態產生很大的衝擊。 　 民國八十三年於工業區址內土地劃設「自然生態保護區」，並命名為「台南市 四草野生動物保護區」。 　 南寮鹽村位於野生動物保護區內，同時由於位於海平面之下，有淹水的疑慮， 因此居民將於民國九十一年年底，遷往地勢較高的北寮。 　 台南市市長許添財於民國九十一年四月二十二日至四草野生動物保護區聽取由 崑山科技大學盧建銘簡報，將原本的南寮鹽村轉變成鹽田文化村，因南寮鹽村 屬於四草野生動物保護區內更名為鹽田生態文化村。臺南市政府規劃六年國家 發展計劃中推動「台江國家風景區」，希望於南寮鹽村設立「鹽田生態文化 村」，希望能設置一個兼顧生態文化和觀光的村落。 　 南寮鹽村遷村後的鹽田生態文化村透過工作團對合作，九十二年四月八日由行 政院文化建設委員會陳郁秀主委啟動鹽田生態文化村。 　 鹽田復育於九十二年五月十六日第一次收鹽，鹽工與三立草地狀元主持人黃西 田一同收鹽。